Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5460Q3UQ97 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5460Q3UQ97 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms