Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms