Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rmi2Q3UPE3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms