Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nhlrc4Q3UP44 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nhlrc4Q3UP44 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nhlrc4Q3UP44 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nhlrc4Q3UP44 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nhlrc4Q3UP44 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nhlrc4Q3UP44 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nhlrc4Q3UP44 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc4Q3UP44 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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