Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxosQ3UL53 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms