Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms