Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms