Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 284.1 ms