Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms