Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LchnQ3UHG7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms