Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mier3Q3UHF3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms