Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms