Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garem1Q3UFT3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms