Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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Rnf180Q3U827 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf180Q3U827 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Rnf180Q3U827 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rnf180Q3U827 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf180Q3U827 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rnf180Q3U827 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rnf180Q3U827 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Rnf180Q3U827 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Rnf180Q3U827 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Rnf180Q3U827 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf180Q3U827 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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