Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc174Q3U155 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc174Q3U155 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms