Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palb2Q3U0P1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms