Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrn4clQ3TYX2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn4clQ3TYX2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn4clQ3TYX2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn4clQ3TYX2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn4clQ3TYX2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrn4clQ3TYX2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms