Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms