Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc136Q3TVA9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc136Q3TVA9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms