Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt2Q3TTY5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt2Q3TTY5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms