Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2afvQ3THW5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms