Protein–RNA interactions for Protein: Q3TFD2

Lpcat1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat1Q3TFD2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lpcat1Q3TFD2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lpcat1Q3TFD2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lpcat1Q3TFD2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms