Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem248Q3TBN1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms