Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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