Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Treml4Q3LRV9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms