Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3KNL4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3KNL4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3KNL4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms