Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M3Q31093 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms