Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp8Q2V6D6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms