Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Shroom4Q1W617 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shroom4Q1W617 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms