Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm1123Q1RME4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms