Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cpne9Q1RLL3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cpne9Q1RLL3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cpne9Q1RLL3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cpne9Q1RLL3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne9Q1RLL3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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