Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim71Q1PSW8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms