Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rpusd3Q14AI6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rpusd3Q14AI6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rpusd3Q14AI6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rpusd3Q14AI6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rpusd3Q14AI6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rpusd3Q14AI6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rpusd3Q14AI6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpusd3Q14AI6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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