Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms