Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atp2b3Q0VF55 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms