Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem52bQ0VBF2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem52bQ0VBF2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms