Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spata18Q0P557 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms