Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc7a1Q09143 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms