Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ebf1Q07802 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms