Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms