Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf9Q07105 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms