Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atf4Q06507 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms