Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms