Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcn1Q05186 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms