Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms