Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Top1Q04750 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms