Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms