Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tff2Q03404 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms