Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Thbs2Q03350 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs2Q03350 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms