Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GscQ02591 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GscQ02591 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GscQ02591 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GscQ02591 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GscQ02591 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GscQ02591 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GscQ02591 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GscQ02591 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GscQ02591 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GscQ02591 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GscQ02591 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GscQ02591 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GscQ02591 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GscQ02591 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GscQ02591 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GscQ02591 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GscQ02591 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GscQ02591 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms